Consejo de Administración
Es el Órgano de Gobierno de este Organismo Descentralizado, integrado por 16 miembros, Consejeros del Sector Público, Privado, Académico y Ciudadano.
Este Órgano sesiona ordinariamente al menos seis veces al año, y extraordinariamente cuando así se convoque. Todas sus sesiones deberán ser públicas y transmitirse en vivo, vía electrónica.

Presidente del Consejo de Administración

Director Ejecutivo
Es quien representa legalmente a la Junta Central ante las autoridades, dentro de sus facultades se encuentra: suscribir y formalizar a nombre de la Junta Central y Organismos Operadores, Acuerdos, Contratos, Convenios y demás actos jurídicos con la Federación, Municipios y Organismos Nacionales e Internacionales, supervisar la aplicación de Programas Federales y Estatales en materia de agua, así como, supervisar a los Organismos Operadores.
Integrantes del Consejo de Administración

Dr. Oscar Fidencio Ibáñez Hernández
Presidente del Consejo de Administración

Lic. Santiago de la Peña Grajeda
Secretaría General de Gobierno

Lic. José de Jesús Granillo Vázquez

M.I. Jorge Ignacio Chanez Peña
Secretaría de Comunicaciones y Obras Públicas

Ing. Gabriel Martin Valdez Juárez

Ing. Mauro Parada Muñoz

Lic. Gilberto Baeza Mendoza
Secretaría de Salud
Dirección Local de la Comisión Nacional del Agua

Ing. Mario Mata Carrasco

Lic. Roberto Anaya Moreno
Secretario del Consejo (Titular de la Dirección Jurídica)

C.p. Horacio Granados Gómez

Dra. María del Rocío Infante Ramírez
Representante de Colegios de Profesionistas

Dip. Arturo Zubía Fernández
Poder Legislativo del Estado, quien ocupe la Presidencia de la Comisión Legislativa en la materia del Agua

Lic. Eduardo Romero Ramos
Representante del sector empresarial, Región Norte, Noreste y Noroeste

Ing. José Robles Stringel
Representante del Sector Empresarial, Región Centro y Sur

Dr. Carlos Ortega Ochoa
Representante del Sector Académico y/o de Investigación

Dr. Luis Carlos Tarín Villamar
Comisionado Estatal para la Protección Contra Riesgos Sanitarios

Lic. Irving Rafael Loera Talamantes
Secretario de Desarrollo Humano y Bien Común